La finestra di configurazione serve a impostare i parametri fondamentali per il funzionamento del programma e il suo utilizzo risulta particolarmente importante per decidere l'aspetto dell'interfaccia e il comportamento che le varie funzioni di Lottodesk assumeranno nel momento in cui saranno utilizzate. La finestra è suddivisa in diversi pannelli, descritti con completezza nelle seguenti pagine:

• Pannello Generale
• Pannello Stampa
• Pannello Archivio 
• Pannello Interfaccia